Los programas bandera de la Fundación son:

INNOVAEMPRESA: Metodología y herramientas para la
aplicación de la innovación en la pequeña y mediana empresa.

INNOVACADEMIA: Metodología y herramientas para la
innovación de la enseñanza, la investigación y el desarrollo a
nivel terciario aplicada al territorio.

INNOVADEL: Metodología y herramientas para la aplicación
de la innovación al desarrollo local sostenible, a partir de la vocación del
territorio desde la perspectiva de la participación de todos los
actores incluidos en la quíntuple hélice; sector público,
academia, empresa, sociedad civil y medio ambiente.